颜色不同，摩根石是浅橙红至桃红色，海蓝宝石是绿色至蓝色。成份不同，除铍铝硅酸盐矿物外，摩根石含锰、铯元素，海蓝宝石含铁元素。荧光性不同，摩根石在X光下呈强荧光，深红色，而海蓝宝石不发光。寓意不同，摩根石寓意爱情，海蓝宝石寓意和平。
摩根石的颜色是浅橙红到浅紫红、玫瑰色、桃红色，海蓝宝石的颜色是蓝色、绿蓝色到蓝绿色，两者颜色完全不同，可明显区分。
摩根石和海蓝宝石的主要成分都是铍铝硅酸盐矿物，但摩根石中含锰元素与少量铯元素和铷元素，海蓝宝石中含有铁元素。这是两者成分的差别，也是导致它们颜色不同的原因。
摩根石有荧光性，在紫外荧光下呈现弱淡紫红色，在X光线下呈强荧光，深红色。海蓝宝石无荧光性，在X光线的照射下不发光。
摩根石的寓意是爱情、好运和力量，海蓝宝石的寓意是和平、幸福和愉快，将其送人时，两者所表示的祝福含义不同。
