海蓝宝石是在岩浆活动晚期的气液充填围岩的裂隙形成的，为气成热液过程中的产物。正是因为如此，所以海蓝宝石的晶体通常较大，并且其内部还具有些许瑕疵。因为地区不同的原因，海蓝宝石的产出方式也有所不同。
海蓝宝石是气成热液过程中的产物，大多来自于伟晶岩晶洞中。经过专家研究表明，海蓝宝石是在岩浆活动晚期的气液充填围岩的裂隙形成的，因此具有充分的结晶时间结晶成较大的单晶体。
海蓝宝石在地质上被称为伟晶岩，其晶体通常较大，并且经常被石英，长石等矿物包裹着，因此海蓝宝石的内部通常具有些许瑕疵，具备宝石的特征。
虽然海蓝宝石是热液产物，但因为其地区不同的原因，海蓝宝石的产出方式也不同。比如哥伦比亚的海蓝宝石含气、液、固三相包裹体，乌拉尔的海蓝宝石具有典型的含似竹带状阳起石针状晶体包和云母片等等。
