在鉴别玉髓和玉的过程中，一般玉髓是隐晶结构，质地细腻，而玉石有稳定的晶体排列结构，它们的化学成分也是不同的，玉髓主要的化学成分为二氧化硅，而玉石的主要成分为铬、铁、铜、铝这三种。而它们的作用也各不相同。
1、晶体形状不同
玉髓是属于隐晶结构，质地细腻，是由二氧化硅的结合形成，可呈现出多种的透明度不同的过渡与演进，与变化，但会在高温下容易发生褪色的现象。而玉石有着稳定的晶体排列结构，虽然和玉髓一样可呈现出不同程度的变化，但是由玉石内部颗粒结构排列而决定的。
2、化学成分不同
玉髓主要的化学成分为二氧化硅，由于它含有铁、铝、锰等微量元素是玉髓的致色因子，而这些元素从而构成了玉髓的颜色与质地的不同。但玉石是含有者许多的微量元素，如锌、铁、铜、锰、镁、钴、硒等多种矿物元素，其中以铬、铁、铜、铝为主要的致色因子，从而玉石的色彩及纹理也会产生不同程度的影响。
3、产地不同
玉髓是在低温和低压的条件下所形成的，而且玉髓它主要产于马达加斯加、巴西、台湾、印尼的地方，而玉石分为软玉与硬玉，玉石的品种是多种多样的，而它的产地也会有所不同，如和田玉主要产于新疆，蓝田玉主要产于陕西，而岫玉主要产于辽宁等。
4、价格不同
玉石是分为软玉和硬玉，其中翡翠是所有玉石里价格为最高，一块好的翡翠价格高达几千万元，而优质的玉髓的价格可达到几万元每克。
5、作用不同
将玉石制作成饰品佩戴在身上，可以起到辟邪，保佑佩戴者平安的主要作用，而长时间的佩戴玉髓可以防止骨骼病变和血液类疾病发生，还可以提高佩戴者的肝胆功能。
