南红早期产于我国南疆，而南疆包括云南、四川南部、青海、甘肃等地区，它的色泽比较鲜艳，质地细腻、温润，有玉质感，主要成分是二氧化硅。而朱砂主要产地为贵州省东部铜仁地区的万山，颜色鲜红，玉质感较差，主要成分是硫化汞。
产地不同是南红和朱砂主要的区别之一，南红因早期产于我国南疆而得名，而南疆包括云南、四川南部、青海、甘肃等地区，朱砂主要产于贵州省东部铜仁地区的万山。
此外南红和朱砂的色泽也存在区别，南红的颜色是鲜艳的，质地细腻、温润，有一种玉质感。而朱砂虽然颜色同样鲜红，但是玉质感稍差，手感不如南红细腻。
南红和朱砂的区别还在于成分不同，南红主要的成分是二氧化硅，它是二氧化硅的胶体凝聚物。而朱砂的主要成分是硫化汞，同时会夹杂雄黄、磷灰石、沥青质等物质。
