对于一个有经验的宝石学家来说，蓝宝石中的包裹体可以作为重要的鉴定线索以判断：
蓝宝石是天然还是合成的
蓝宝石是否经过处理
蓝宝石的开采地点/区域（产地鉴定）
蓝宝石的包裹体可以为宝石鉴定提供线索，以探寻蓝宝石是在什么样的地质环境中形成的，从而有可能进一步确定该蓝宝石的地理产地。而包裹体是宝石内部的物质：它可能在蓝宝石形成之前、形成期间或结晶之后形成，包裹体可以是固体、液体或气体。
未经加热处理的缅甸蓝宝石中的片状包裹体。照片：Michael Krzemnicki, SSEF
上图：克什米尔蓝宝石中的韭闪石针状晶体。下图：一枚克什米尔蓝宝石中的电气石包裹体。照片：Michael Krzemnicki, SSEF
上图：克什米尔蓝宝石中的云朵状包裹体。下图：克什米尔蓝宝石中的延伸至宝石表面的细柱状锆石晶体，它可以被用作年代测定。照片：Michael Krzemnicki, SSEF
来自马达加斯加的蓝宝石中常见的不同的生长分区（‘区块状’）。照片：Michael Krzemnicki, SSEF
上图：细微镜下的来自斯里兰卡的蓝宝石。下图：斯里兰卡蓝宝石中的气液及石墨包裹体。照片：Michael Krzemnicki, SSEF
上图：热处理后的蓝宝石中的‘色点’现象。下图：热处理后的蓝宝石中的一个‘环礁’结构：因为受到高温，蓝宝石中的包裹体膨胀而出现的应力圈。照片：Michael Krzemnicki, SSEF
