小叶紫檀佛珠手串可以通过闻气味来鉴别，揉搓小叶紫檀佛珠手串后，真正的小叶紫檀佛珠手串会散发特殊的檀香，而假的小叶紫檀佛珠手串会散发其它异味。此外真正的小叶紫檀都会有细长的棕眼，而假的小叶紫檀不具备这种特征。
鉴别小叶紫檀佛珠手串可以闻气味，用手揉搓小叶紫檀佛珠手串后，真正的小叶紫檀经过揉搓会散发出特殊的檀香味，而假的小叶紫檀会散发出异味。
此外鉴别小叶紫檀佛珠手串也可以看棕眼，真正的小叶紫檀都会有细长的棕眼，而棕眼也被称为牛毛纹，是小叶紫檀最重要的特征，而假的小叶紫檀具备这种特征。
小叶紫檀佛珠手串还可以通过看颜色来鉴别，刚做出来的小叶紫檀佛珠手串颜色偏橘黄色，之后颜色会转加深变红、变深红、变紫、变黑，而假的小叶紫檀不会发生颜色变化。
