百香籽上的黑点可以清洗干净，这属于正常现象，是百香籽果肉残留所形成的，因此百香籽上的黑点难以清除。清除百香籽黑点可以先将其浸泡在温水中，30分钟后刷洗干净并盘玩，也可以用钢针将百香籽上的黑点挑干净。
百香籽的黑点是可以被盘掉的，其实百香籽上面的黑点并不影响盘玩，因为这是正常现象，是百香籽果肉残留所形成的，由于百香籽上的纹路瑰丽，再加上本身尺寸偏小，所以百香籽的清理难度较大，上面的小黑点也就难以清除。
清除百香籽上的黑点有两种方法，第一种方法是先将百香籽浸泡在温水中，30分钟后用铜丝刷子将上面的黑点刷洗干净，并将百香籽晾干。这时的百香籽就能继续盘玩了，盘出的包浆能将原有的黑点痕迹直接掩盖掉，并看不出什么痕迹。
另一种方法是使用钢针，将百香籽表面的黑点一个个挑干净，但这种方法可以说是非常浪费时间，并且只适用于黑点比较小，还难以清理的百香籽，因此使用较少。
