化学成分，黄宝石的主要化学成份是二氧化硅，黄水晶是内部的二氧化硅结晶完美时形成的；比重，黄宝石的比重为3.95，比重较大，黄水晶的比重为2.6，比重较小；硬度，黄宝石的莫氏硬度为9，质地较硬，黄水晶的莫氏硬度为7，质地较软。
黄宝石和黄水晶的化学成分是不同的，黄宝石是一种复杂的硅酸盐，其主要化学成份是二氧化硅。黄水晶是一种无色透明的石英结晶体矿物，是内部的二氧化硅结晶完美时形成的。
黄宝石的比重较大一些，其重量为3.95，黄水晶的比重较轻一些，其重量为2.6。所以可以用手掂其重量在区分两者，黄宝石比黄水晶压手一些。
黄宝石和黄水晶硬度也是有区别的，黄宝石的莫氏硬度为9，质地较硬，不容易产生划痕。黄水晶的莫氏硬度为7，质地较软，相比于黄宝石，更容易留下划痕。
