水晶分类有以下3种：1、显晶类，由六方晶系生成一簇的水晶簇，例如白水晶、紫水晶、黄水晶等；2、隐晶类，虽然属于六方晶系，但并非六角水晶簇状，晶体呈六角开结晶；3、特别类，由于造型怪异，难以归为显晶类或隐晶类，如骨干水晶等。
水晶大致被分为显晶类、隐晶类、特别类。显晶类水晶是由多条六角形水晶柱，即六方晶系生成一簇的水晶簇，例如白水晶、紫水晶、黄水晶、虎眼石、发晶、粉晶等。
隐晶类水晶虽然属于六方晶系，但却并不是六角水晶簇状，并且晶体十分细小，用显微镜观察隐晶类水晶表面，可见六角开结晶，因此隐晶类水晶触手平滑滋润，例如玛瑙
特别类水晶与一般水晶相比，区别比较大，造型也比较怪异，所以难以归为显晶类或隐晶类，例如骨干水晶、幻音水晶等，比较容易辨认。
